Megatron entwickelt einen Transformationsvirus (laut einer Fanfic basierend auf der in den Marvel Comics vorgekommenen Energiequelle Nukleon), der allen Transformers auf Cybertron erst die Fähigkeit zum Verwandeln raubt und sie dann erstarren lässt. Megatron raubt den hilflosen Transformers die Sparks und baut aus ihren Körpern eine Armee sparkloser Dronenkrieger, seine Vehicons.
Als die Maximals schließlich Cybertron erreichen werden sie vom Verteidigungssystem unter Megatrons Kontrolle abgeschossen. Sie stürzen ab und werden direkt nach dem Abstutz von Vehicons mit dem Transformatiosnvirus beschossen. Diejenigen Maximals, deren Körper Transmetal Technologie enthalten (Optimus Primal, Rattrap, Cheetor und Black Arachnia), reagieren jedoch anders auf den Virus als normale Transformers. Sie verlieren zwar ebenfalls ihre Fähigkeit zum Verwandeln und stecken nun in ihren Tierkörpern fest, aber sie erstarren nicht. Sie verlieren jedoch ihr Kurzzeitgedächtnis.
Hier beginnt die erste Staffel von Beast Machines:
Ohne zu wissen wie er hierher kam erwacht Primal in der Episode „The Reformatting / Das Orakel“ auf Cybertron, gefangen in seiner Gorillaform, und wird von Vehicons verfolgt. Von einem seltsamen Instinkt geleitet findet er Cheetor, Rattrap und Black Arachnia, die sich im selben Zustand befinden. Auf der Flucht vor den Vehicons wird Primal zum Orakel geführt, einem Interface des mythischen Vector Sigma Supercomputers. Das Orakel befindet Primal für würdig und gibt ihm einen direkten Draht zur Matrix, der Dimension aus der alle Sparks kommen. Primal, Cheetor, Rattrap und Black Arachnia erhalten neue, techno-organische Körper, die zu gleichen Teilen technologisch und organisch sind. Mit den neuen Körpern können sie sich der Vehicons erwehren, stellen aber bald fest, dass sie das Transformieren neu lernen müssen. Nur durch vollständige Selbstkontrolle können sie Robotergestalt annehmen.
Auf der Suche nach Antworten erforschen die Maximals in der Episode „Master of the House / Cybertropolis“ Cybertron. Bis auf die Vehicons scheint der Planet entvölkert und alle Archive sind gelöscht. Im ehemaligen Sitz des Maximal Ältestenrats stoßen sie auf Megatron, der sich direkt mit Cybertron verbunden hat und den gesamten Planeten inklusive aller Vehicons direkt kontrolliert. Megatron protzt mit seiner Herrschaft über Cybertron und dass er vorhat, eine Welt reiner Technologie zu erschaffen, auf der halborganische Wesen wie die Maximals nicht mehr existieren. Die Maximals müssen fliehen.
(Woher Megatrons plötzlicher Hass auf alles organische kommt wird nicht erklärt und ist einer der Hauptkritikpunkte an der Serie.)
In der Folge „Fires of the Past / Spur in die Vergangenheit“ erkennt Megatron, dass seine ferngesteuerten Vehicon Dronen alleine nicht ausreichen und erschafft aus drei gefangenen Sparks seine drei Generäle, Jetstorm, Thrust und Tankor. Die Maximals begegnen diesen auf dem zentralen Raumflughafen von Cybertron, wo die Überreste ihres alten Shuttles liegen. Blach Arachnia verbindet sich mit der Datenbank des Shuttles und findet einen Teil ihrer Erinnerungen wieder, u.a. dass zwei der Maximals, nämlich Rhinox und Silverbolt, verschollen sind. Bevor sie mehr herausfinden kann müssen die Maximals jedoch fliehen und das Autobot Shuttle wird im Kampf zerstört. Megatron versucht indessen seinen Körper von allen organischen Elementen (seinem Drachenmodus aus Beast Wars) zu säubern, dies stellt sich jedoch als kompliziert dar.
Primal versucht in der Folge „Mercenary Pursuits / Die Jagd“ Tankor auf seine Seite zu ziehen, indem er seinen Spark über die Matrix kontaktiert. Dies gelingt ihm zuerst, jedoch löscht Megatron Tankors Kurzzeitgedächtnis wieder und dreht ihn damit wieder um. Während des Kontaktes kommt Tankors Spark Primal bekannt vor.
Dass der Planet Cybertron einmal organische Ursprünge hatte stellt sich in der Folge „Forbidden Fruit / Nachtgestalten“ heraus, in der die Maximals einen Überlebenden des Transformationsvirus finden, den jungen Nightscream. Dieser fiel während der Vehicon Invasion in einen tiefen Schacht und erwachte in Form einer Fledermaus. In seiner Behausung findet sich eine Gruppe organischer Bäume. Um eine Vehicon Attacke abzuwehren reformatiert Primal Nightscream in einen technoorganischen Transformer wie die anderen, die Anstrengung setzt ihn jedoch eine zeitlang außer Gefecht. Cheetor übernimmt temporär das Kommando.
Die Folge „Weak Component / Rattrap“ ist die vielleicht schlechteste der gesamten Serie, da hier der Veteran Rattrap als unsicherer Schwächling dargestellt wird, der sich, nur um einen stärkeren Körper zu bekommen, zeitweise mit Megatron gegen die Maximals verbündet. Sämtliche Charaktere verhalten sich in dieser Folge atypisch, je weniger darüber geschrieben desto besser.
Die Maximals erfahren schließlich die ganze Geschichte ihrer Ankunft auf Cybertron in der Dreier-Folge „Revelations / Gefährliche Entdeckung“. Zuerst finden Sie heraus, dass die Vehicons aus den Körpern lebloser Transformer gebaut werden. Während eines Kampfes schützt Thrust unerklärlicherweise Black Arachnia. Von den anderen getrennt finden sie eine von Megatrons Spark-Extraktions Anlagen, wo er hilflosen Transformers die Sparks genommen hat. Thrust wird von lückenhaften Erinnerungen an die prähistorische Erde gequält, was Black Arachnia glauben lässt, dass sein Spark der ihres Liebhabers Silverbolt ist. Dies stellt die Maximals vor die Frage, wie sie die Vehicon Generäle besiegen sollen, ohne die in ihnen befindlichen Maximal Sparks zu schädigen.
Im zweiten Teil des Dreiteilers geht Primal in eine tiefe Trance um mehr von Orakel zu erfahren. Dort sieht er einen organischen Planeten, der von einer Welle aus Metall überrollt wird. Mittlerweile fangen die anderen Maximals Tankor und versuchen ihn wieder zu einem Maximal zu machen. Durch eine Verbindung erfährt Rattrap, dass Tankor sich an die Reise von der Erde zurück nach Cybertron erinnert. Durch seine Erinnerung erfahren die Maximals, was mit ihnen bei der Ankunft auf dem Planeten geschehen ist. Rattrap erkennt, dass Tankors Spark der von Rhinox ist. Woanders versucht Black Arachnia in Thrust den Spark von Silverbolt zu erwecken. Jetstorm zwingt Thrust seine Loyalität zu beweisen und Thrust streckt Black Arachnia nieder. Jetstorm extrahiert ihren Spark.
Im Finale des Dreiteilers rettet Nightscream den Spark von Black Arachnia und bringt ihn zu ihrem Körper zurück. Tankor erwacht und ist nun nicht mehr ein dummer Muskelprotz, sondern hat seine alte Intelligenz wieder. Er greift die Maximals jedoch sofort an. Durch Telepathie erfährt Primal, dass Rhinox’ Spark durch Megatron bis ins tiefste korrumpiert wurde. Er unterstützt nun freiwillig Megatrons Plan, ein rein technologisches Cybertron ohne Individualität zu erschaffen. Primal lehnt den Vorschlag Rattraps ab, Tankor zwangsweise umzuprogrammieren, da sie das nicht besser als Megatron machen würde. Primal eröffnet den anderen Maximals ihre Aufgabe, wie sie ihm vom Orakel vermittelt wurde: Sie sollen die Balance zwischen Technologie und Organischem auf Cybertron wieder herstellen.
Die Folge „Survivor / Nightscream“ eröffnet Nightscreams Ursprung. Bei seinem Fall in die Tiefen Cybertrons stieß er auf eine Höhle mit Fosilien aus Cybertrons organischer Vergangenheit. Die Maximals finden außerdem weitere organische Bäume und beginnen damit, einen ersten Garten anzulegen, ein erster Schritt in Richtung Balance zwischen Technologie und Organischem. Tankor reprogrammiert eine von Megatrons Dronen, um Megatron auszuspionieren. Er sieht sich selbst als besserer Herrscher eines reinen Cybertron, da Megatrons Körper immer noch organische Elemente enthält. Er findet das Orakel und will es zu seinen eigenen Zwecken nutzen.
Dass es sich bei dem Orakel in Wirklichkeit um Vector Sigma handelt findet Tankor in der Folge „The Key / Der Schlüssel“ heraus. Er findet auch das Schlüsselprogramm des Computers (bekannt aus der G1 Doppelfolge „The Key to Vector Sigma“) welches organische in technologische Materie verwandeln kann. Er greift dann den Garten der Maximals an und beginnt, die Bäume zu ‚technisieren’. Tankor muss sich schließlich zurückziehen, aber nicht bevor er Black Arachnia und Nightscream mit dem Schlüssel verwandelt. Die Maximals finden heraus, dass organischer Schleim aus Cybertrons organischem Kern den Prozess rückgängig machen kann. Tankor inszeniert seinen eigenen Tod und plant, Megatron und Primal sich gegenseitig vernichten zu lassen.
In der Folge „The Catalyst / Vector Sigma“ spielt Tankor das Schlüsselprogramm Megatron zu, in der Hoffnung dass dieser es gegen die Maximals einsetzen wird und damit sich selbst vernichtet, da er noch organische Komponenten hat. Mittlerweile nutzt Black Arachnia organischen Schleim, um Thrust an seine alte Identität zu erinnern. Zu ihrem Schrecken stellt sie jedoch fest, dass es sich bei Thrust nicht um Silverbolt handelt, sondern um Waspinator. Waspinator verließ die prähistorische Erde aus Langeweile und fiel bei seiner Rückkehr nach Cybertron unter Megatrons Herrschaft. Als Jetstorm die beiden angreift wird er von dem Schleim getroffen. Er ist Silverbolt. Bevor Black Arachnia die Verwandlung dauerhaft machen kann werden sie jedoch von Vehicons angegriffen, die mit dem Schlüsselprogamm Jetstorm und Thrust wieder zurückverwandeln. Während Primal feststellt, dass das Orakel dank Tankor nicht mehr mit ihm kommuniziert, baut Megatron als letzte Waffe gegen die Maximals eine Anlage, um ganz Cybertron mit dem Schlüsselprogramm zu bestrahlen und alles organische auf einen Schlag zu vernichten.
Die erste Staffel endet mit dem Finale „End of the Line / Die Vision“. Tankor versucht eine Schlacht zwischen Megatron und Primal zu erzwingen und führt die Maximals zur Plasma Energie Kammer (bekannt aus dem G1 Dreiteiler „The Rebirth / Die Wiedergeburt“). Die Plasma Energie vernichtet alles technologische, verschont jedoch organisches. Tankor weiß zwar, dass Primal die Energie nicht einsetzen wird, da sie alles technologische Leben auf Cybertron vernichten würde, hofft jedoch, dass es Megatron bewegen wird, das Schlüsselprogramm einzusetzen. Alles endet in einer finalen Schlacht, bei der Megatron die Maximals mit dem Schlüsselprogramm ausschaltet und Tankor Primal von hinten niederstreckt. Als Tankor sich jedoch gegen Megatron wenden will kann er es nicht, sein Programm erlaubt es nicht. Megatron wusste die ganze Zeit von Tankors Plänen und hat sie benutzt um an den Vector Sigma Schlüssel zu gelangen. Primal, der keinen anderen Ausweg mehr sieht, setzt die Plasma Energie frei. Megatron aktiviert im Gegenzug seine Waffe, die den ganzen Planeten mit dem Schlüsselprogramm überflutet. Die Energien beider Waffen verbinden sich und im Zentrum des Chaos stehen Primal und Megatron Auge in Auge.
Ende Staffel 1
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Texte mit freundlicher Genehmigung von Transformers-Universe.com übernommen.